液滴数字PCR检测BK病毒试剂盒设计研发

作者:赵垭婷 中山大学附属第一医院 来源: 发布时间: 2022-03-11 点击数量:0

从建立初始定性检测单个靶序列,到实现病原体间接定量检测,再到直接绝对定量,PCR技术已发展至第三代——液滴数字PCRDroplet Digital PCR)。ddPCR是一种基于液滴平台的核酸分子定量技术,将PCR与液滴微流控技术相结合,扩增前将含有样品的PCR预混液制备成成千上万纳升级别的微滴,核酸分子包裹在微滴中可独立进行PCR扩增,从而实现短时间内DNA片段的指数级扩增 。随后对微滴进行逐个检测,将微滴中含靶基因片段与不含靶基因片段的液滴分别标为10,结合泊松分布,可计算出待检样品中的靶基因分子的具体个数或浓度。因此,ddPCR能实现对核酸分子的高灵敏度、高精确性、高特异性的无标准曲线直接绝对定量。


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目前监控BK病毒感染的主流实验室检查方法有尿沉渣检测诱饵细胞、实时荧光定量PCR检测尿液和血BK病毒DNA载量以及作为诊断BKVN金标准的移植肾组织活检加免疫组化阳性等。但结合国内外文献,这些方法分别存在着灵敏度、特异度低,耗时长,损伤大等不足。基于此我科与北京新羿生物科技有限公司展开合作,设计并建立一套有效的液滴数字PCR检测BK病毒的方法,并研发成检测BK病毒的试剂盒,进一步实现肾移植受者BK病毒快速有效的检测。


设计特异性引物探针,优化反应体系并收集相应临床样本应用北京新羿生物科技有限公司Drop Maker M1样本制备仪和Chip Reader R1生物芯片分析仪对试剂盒进行验证。

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新羿微液滴数字PCR平台具备一定优势。首先,设计了新型防污染微液滴生成芯片,在微滴生成之后通过密封管道将微滴转移到八连排管中,无需转移液滴,可避免模板污染。

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其次,芯片分析采用准共焦光路,与荧光成像相比荧光收集效率高,分辨率高;检测单个液滴,区域小,背景噪声小;荧光传感器PMT自身灵敏度和信噪比高;阴阳性液滴区分更明显,在结果自动划分、多重反应都有明显优势。

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多重防污染设计,操作流程简单易学,配合正在研发的BK试剂盒相信在不久的将来,可实现对BK病毒的更快速、更灵敏的检测。


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